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As características de qualidade das águas dos recursos hídricos dependem diretamente da interferência antrópica, tanto no que se refere à poluição gerada quanto à forma com que se usa e ocupa o solo nas bacias hidrográficas. Essa intensa poluição, combinada com um elevado consumo humano, contribui para a escassez deste recurso e promove a necessidade do acompanhamento de sua qualidade e dos fatores que o alteram. No caso de países subdesenvolvidos, como o Brasil, o lançamento indiscriminado de esgotos domésticos ou industriais sem tratamento nos corpos d’água trás consequências graves ao meio ambiente e à saúde pública. Por conta disto, é que Guarulhos, em 2010, inaugurou a sua primeira Estação de Tratamento de Esgoto (ETE - São João), com uma capacidade de tratar até 15% do esgoto coletado de toda a cidade. A ETE foi construída próxima da margem do rio Baquirivú-Guaçu, um dos principais rios da cidade, mas que ainda sofre com problemas de poluição e assoreamento ao longo de seu curso. O rio nasce em Arujá, cruza o município de Guarulhos, passa por regiões de diferentes níveis de urbanização e deságua no rio Tietê. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade da água do rio Baquirivú-Guaçu, à montante e à jusante da ETE – São João, por meio de análises de amostras de água coletadas em quatro pontos distintos (dois à montante e dois à jusante da ETE). Os parâmetros de qualidade analisados foram pH, Temperatura, Turbidez, Condutividade, OD e DBO_5,20. Os piores resultados foram obtidos no Ponto 3 (à jusante da ETE), com valores de Condutividade alterada (486 ± 4 µS/cm) e Turbidez elevada (998 UNT), sendo que o limite estabelecido pela Resolução CONAMA nº357/05 é de no máximo 100 UNT. Portanto, concluiu-se que a alteração desses parâmetros pode ser resultado do processo de urbanização e ocupação desordenada de sua Bacia e da poluição difusa que o rio recebe desde saída da ETE até a proximidade do Ponto 3, devido, possivelmente, a maior proximidade deste ponto com o Aeroporto Internacional de Guarulhos-SP e com a Rua Jamil João Zarif, via de acesso muito movimentada da região.